Gümrük Müşavirleri Derneklerinin, Menşe Şahadetnamelerinin sorgulanması aşamasında;

-Sonradan kontrole gönderilen evraklar için yükümlüye tebligat yapılmadığı,
-Sonradan kontrole gönderilen evrakların cevap verme sürelerinin aşılmış olmasına rağmen cevap alınamayan durumların bulunduğu,
-Başvurunun hatalı mercilere yapılması ya da başvuru makamlarında değişiklikler yaşanmasından kaynaklı cevap alınamayan durumlar bulunduğu,
-Yetkili makam adresinin temin edilememesi sebebi ile yazışma yapılamayan durumlar bulunduğu,
Sonradan kontrol sürecinin tamamlanmamış olmasına rağmen ek tahakkuk kararı, zaman zaman ise 2014/1 sayılı Tebliğ’ e aykırı olarak ceza kararı düzenlendiği,

Vb. şekillerde sıkıntılar yaşandığı ile ilgili olarak Gümrükler Genel Müdürlüğüne yazdığı yazı ve Genel Müdürlüğün cevabi yazıları ektedir.